El Archivo Guaiquerí cuenta con el respaldo del Modern Endangered Archives Program (MEAP) de la UCLA Library, que promueve la preservación y acceso a fondos documentales en riesgo a nivel global. Asimismo, el proyecto se nutre de los intercambios y colaboraciones con la red académica del Caribbean Digital Scholarship Collective, con el Museo Marino de Margarita “Fernando Cervigón”, y con la Fundación Soy Identidad, instituciones clave en la conservación, preservación y difusión del patrimonio insular y caribeño.